Agilent 2100生物分析仪系统是一个能够在独立平台上完成DNA、RNA、蛋白质的分子量测定、定量分析与质量控制的多功能系统。
工作原理
Agilent 2100 生物分析仪的独特优点在于它既可用于电泳分离,又能进行细胞荧光参数的流式分析,既提高了数据精确度和重复性,缩短分析时间,最大限度地降低样品消耗,又提高复杂工作流程的自动化和完整性,其工作原理如图1所示,包括:①样品自样品孔处沿微通道移动;②样品被注入分离通道;③样品组分通过电泳被分离;④各组分通过其荧光被检测并转化成凝胶样图像(条带)和电泳色谱图(峰)。
实验流程
2100生物分析仪将传统的凝胶电泳原理运用到芯片上,在很大程度上减少了样品分离所用的时间、样品用量及试剂损耗,实验操作也以“简易”一词为主,以RNA Nano6000 chip为例,如图2所示,按Agilent 2100芯片操作SOP依次将胶-染料混合液、marker、Ladder、样品等加入对应的芯片孔内,随即放入 2100 Bioanalyzer进行分析。
结果分析
安捷伦2100生物分析仪的另一大优势是通过芯片实验室微流控技术平台可对RNA的完整性、纯度或降解程度进行精确的、数字化的评估。以细胞样本的Total RNA为例,从2100 Bioanalyzer分析完的的实验结果(如图3)所示,我们可以清晰明了地得到以下数据信息:
1.RNA Concentration: 能够较为精确的判断Total RNA 样本的浓度;
2.RNA Integrity Number (RIN): 评估RNA完整性的工具,RNA质量控制的标准,直观地判断出RNA样本的降解程度。RIN值范围为1~10,不同数值代表着样品RNA的不同降解程度,通常,RIN值越高,表明RNA质量越好,则二代测序的数据质量也越高;
RIN值>7,:高质量RNA;
RIN值6-7:部分RNA降解,勉强可用;
RIN值<6:质量较差RNA。
举例:从各种组织、细胞中提取DNA或RNA,同时做Agilent 2100电泳。
如RNA的电泳图:RNA电泳,判断RNA的降解程度,应用于基因芯片、高通量转录组测序、普通RT后的定量分析。检测灵敏度,定量:25ng/ul;定性:5ng/ul
DNA电泳,可以准确判断杂峰等现象,同时对弥散的DNA条带进行范围鉴定,可以对低至0.1ng的DNA进行电泳判断,应用于高通量测序前的样品、文库QC。
特点总结
1. 快速获得结果,30 分钟内完成 11 个样品的自动化分析。
2. 不需要手动染色和脱色步骤,所有的程序集中到一个步骤中实现。
3. 检测精确度提高,预包装的试剂和标准化检测方法可产生高度可再现结果
4. 可分析多种蛋白质样品,细胞消化液、柱层析组分、抗体和纯化的蛋白质
5. 样品消耗量最低,每个分析仅需要1 ul稀释后的样品。
6. 样品对照快速容易,只需单击重叠分析,具有图象缩放功能。
7. 数字数据易于归档和存储,与他人共享数据,输出数据用于发表或者进行陈述。
8. 在一个检测中可以定性和定量分析,可以进行绝对和相对定量(半定量)
9. 多种数据显示选项,结果可以类似凝胶的影像、电泳图谱以及表格格式显示。
10. 数字操作,可对实验进行精细的分析。